Outros power-ups, como o Frog e o Tanooki Suit, alteram totalmente a gameplay, sendo úteis em ocasiões específicas. Por exemplo, o Frog Suit é ideal para fases aquáticas, facilitando o movimento e o controle de Mario debaixo d’água. A Tanooki Suit, além de permitir também que Mario possa voar, pode transformar o personagem em pedra por alguns instantes. Essa habilidade é uma referência ao mito japonês dos tanuki, criaturas mágicas conhecidas por se transformarem para se proteger ou pregar peças. No Japão, o tanuki é associado à sorte e à travessura, o que dá ainda mais charme à inclusão dessa referência no jogo.

Existem também agora os itens que podem ser usados no minimapa. O martelo quebra pedras, abrindo caminhos antes bloqueados; as caixinhas de música colocam os Hammer Bros. para dormir por algumas rodadas. Já a nuvem permite ao jogador passar por uma fase sem jogá-la, sendo especialmente útil para evitar fases difíceis ou para avançar rapidamente em momentos estratégicos. Ativações específicas liberam novas casinhas do Toad e um navio cheio de moedas, que surgem em condições especiais; questões essas que, inclusive, envolvem conquistas específicas no RetroAchievements.

Se isso tudo não bastasse, ainda é possível jogar Super Mario Bros. 3 em modo multijogador cooperativo, onde cada um passa uma fase, ou competitivo, em um joguinho semelhante ao Mario da época dos Arcades. Trata-se de uma quantidade absurda de conteúdo adicional, tudo minuciosamente disponível para o jogador. Tudo isso é apresentado de forma tão orgânica que o jogo sequer possui tutoriais, uma das maiores habilidades da Nintendo até hoje ao fazer seus principais jogos.